敲除CTLA-4可以提高CAR-T細(xì)胞抗腫瘤療效
在機(jī)制上,CTLA-4缺失允許CD28的信號傳導(dǎo),并可維持T細(xì)胞表面的 CAR 表達(dá)。在臨床研究中,CTLA-4的缺失挽救了以前CAR-T治療失敗的白血病患者的T細(xì)胞功能。因此,CTLA-4的選擇性缺失使功能失調(diào)的慢性淋巴細(xì)胞白血?。–LL)患者的T細(xì)胞重新活躍,為增加患者對CAR-T細(xì)胞治療的反應(yīng)提供了一種新的策略。 為了評估CRISPR/Cas9介導(dǎo)的PD-1和CTLA-4檢查點受體缺失是否可以提高靶向CD19的嵌合抗原受體T細(xì)胞(CART19)的療效,他們制備了人源化的CART19細(xì)胞進(jìn)行實驗。在確保有效敲除的基礎(chǔ)上,他們發(fā)現(xiàn)PD-1和/或CTLA-4缺失的CART19細(xì)胞表現(xiàn)出類似的增殖能力、記憶表型、抑制受體水平和表面CAR表達(dá)。同樣地,WT和編輯過的CART19細(xì)胞顯示出同等水平的細(xì)胞毒活性、脫顆粒能力等。 為了確定是否缺失PD-1和/或CTLA-4可以預(yù)防或延遲CAR-T功能障礙,他們開發(fā)了一種使用慢性抗原暴露(CAE)的體外應(yīng)激試驗。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與PD-1缺陷的CART19細(xì)胞和PD-1/CTLA-4均缺陷的CART19細(xì)胞相比,CTLA-4 缺陷的CART19細(xì)胞表現(xiàn)出雙倍擴(kuò)增能力和抗腫瘤功效增強。
在進(jìn)一步的應(yīng)激測試中,與WT、PD-1缺陷的CART19細(xì)胞和 PD-1/CTLA-4均缺陷的CART19細(xì)胞相比,CTLA-4缺陷的CART19細(xì)胞分泌的GM-CSF、IL-13和CCL5水平增加。在CAE刺激條件下,CTLA-4缺陷的CART19細(xì)胞都比WT細(xì)胞表現(xiàn)出更高的擴(kuò)增能力和腫瘤清除能力。
為了研究驅(qū)動CTLA-4缺失CAR-T細(xì)胞提高抗腫瘤療效的分子途徑,他們對CAE刺激后第0天和第15天的WT和CTLA-4缺失CAR-T細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序 (scRNA-seq)。為了深入了解CTLA-4的缺失如何影響T細(xì)胞的廣泛分布,他們繪制了每個亞群中的相對細(xì)胞數(shù)量。有趣的是,在第15天,與WT CART19細(xì)胞相比,CTLA-4缺失的CART19細(xì)胞在增殖亞群中的細(xì)胞比例更高,而在終末效應(yīng)亞群、應(yīng)激亞群和凋亡亞群中的細(xì)胞比例更低。這些數(shù)據(jù)提供了關(guān)于CTLA-4缺失CAR-T細(xì)胞如何優(yōu)于WT CAR-T細(xì)胞的見解。為了從體外應(yīng)激功能障礙模型中識別功能障礙基因,他們在CAE刺激后第0天和第15天測定了差異表達(dá)基因。他們觀察到了衰竭基因的上調(diào),如CTLA-4、HAVCR2、LAG-3、KLRD1、IL-2RA、ENTPD1、GNLY、LAYN、CCL3、CCL4、TNFRSF18 和DUSP4。
為了從機(jī)制上理解CTLA-4缺失如何促進(jìn)白血病患者CAR-T細(xì)胞在應(yīng)激測試后抗腫瘤療效的提高,他們鑒定并比較了來自ND和CLL CAR-T細(xì)胞的WT和CTLA-4缺失細(xì)胞的DEGs。在CTLA-4缺失的ND和CLL CAR-T 細(xì)胞中有許多常見的上調(diào)通路,糖酵解是唯一被下調(diào)的通路。在應(yīng)激測試后的ND和CLL CTLA-4缺失CAR-T細(xì)胞中,參與細(xì)胞周期調(diào)控的通路也出現(xiàn)在上調(diào)的通路中。這表明,在CAR-T細(xì)胞中缺失免疫檢查點CTLA-4促進(jìn)了T細(xì)胞的擴(kuò)增。
他們進(jìn)一步在WT和CTLA-4缺陷的ND和CLL CAR-T細(xì)胞中檢測了CD28下游靶點的表達(dá)。CTLA-4缺失CAR-T細(xì)胞顯示GZMB、IL-2RA和 CDK6的上調(diào),這些基因有助于更好的增殖和發(fā)揮效應(yīng)功能。此外,與WT CART19細(xì)胞相比,CTLA-4缺失CAR-T細(xì)胞的CD28共刺激水平增強。這也在異種移植小鼠模型中得到了重現(xiàn),即與WT CLL CAR-T細(xì)胞相比,CTLA-4缺陷小鼠的外周血CAR-T細(xì)胞中檢測到細(xì)胞表面CD28的表達(dá)增加。基于這些數(shù)據(jù),他們提出,CTLA-4在CAR-T細(xì)胞中的缺失導(dǎo)致了CD28信號的增強,從而維持了CAR-T細(xì)胞的共刺激和減少了CAR-T細(xì)胞功能障礙,這共同提高了CAR-T細(xì)胞的效應(yīng)功能,增加了其增殖,并維持了細(xì)胞表面CAR的表達(dá)。
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